学院于2001年5月成立，设有食品科学与工程、食品质量与安全和蜂学三个本科专业，有食品科学与工程系、食品质量与安全系、蜂学系、学院综合办公室和党群办公室等教学、行政管理机构；有农产品加工及贮藏工程和食品科学2个硕士点；有农业推广硕士食品加工与安全领域招收权；有2个研究所：食品科学研究所和东方蜜蜂研究所；1个省级重点学科：动物性食品科学；1个校级重点扶持学科：农产品加工及贮藏工程；1个云南省高校重点研究工程中心：蜜蜂资源可持续利用研究工程中心；1个云南省研究生教育创新联合培养基地和4个校内实践教学基地；现有教职工42人，其中正高职10人，副高职8人；博士生导师1人，硕士生导师12人；具有博士、硕士学位20人；在校本科生571人，硕士研究生44人。

目前学院主持国际合作项目4项，国家科技支撑计划及国家自然科学基金项目6项、省部级等项目22项、地厅级项目18项，在研经费1000余万元，为人才强院、科研兴院、科研相长打下坚实基础。同时已形成了一批研究成果：先后获省政府科技进步一等、二等奖各1项、三等奖4项，受理和授权国家发明专利16项，主编、副主编及参编专著20余部，发表论文450余篇（SCI收录18篇，EI收录2篇）。学院先后与美国、德国、韩国、日本、泰国、越南等十几个国家和地区相关院校进行学术交流和科教合作关系。学院在昆明承办过“全国蛋品科技大会”、 “中国蜂产品信息交流暨昆明蜂产品博览会”等学术会议，参加过国际学术交流会议10余次，国内学术会议“全国第五届肉品科技大会”、“首届乳业科技大会”等50余人次。通过交流学习，不断提高学院的综合实力。

学院在办学过程中，以教学为中心，以学生为本，坚持教学、科研、生产相结合的办学思路，努力探索教学发展规律，不断提高教学质量，加强对学生综合素质尤其是实践技能的培养，在畜产品加工、果蔬贮藏加工、蜂学及其产品加工和农产品分析检测与质量控制等方面尤具特色。